Η προσφορά τους στον αθλητισμό είναι το κύριο κριτήριο για την επιδότηση, ενώ σημαντικό ρόλο στο ύψος του ποσού παίζει η δύναμη αθλητών που έχει το κάθε σωματείο (παιδιά κυρίως).
| Αθλητικά Σωματεία | Επιδότηση 2011 | Επιδότηση 2012 |
| Πανναξιακός Α.Ο. | 25.000 | 25.000 |
| ΑΟΝ Πανναξιακός | 17.000 | 18.000 |
| Ναξιακός Γ.Σ. | 7.000 | 8.500 |
| Αναγέννηση Νάξου | 8.000 | 8.000 |
| Σύλλογος Πολεμικών Τεχνών «Ήρεμη Δύναμη» | 1.500 | 1000 |
| Σκοπευτικός Σύλλογος | 2.000 | 1.500 |
| Αερολέσχη | 1,000 | 1000 |
| Σύλλογος Βετεράνων Αθλητών Νάξου | 2,000 | 500 |
| ΑΜΣ Φιλωτίου «Ο Ζευς» | 8.000 | 9.000 |
| ΑΟ Αστέρας Τραγαίας | 5.000 | 6.000 |
| ΑΕΝ – Ολυμπιακός (Αριάδνη) | 1000 | 1.000 |
| ΑΠΑΣ «Τα Φανάρια» Απεράθου | 3.000 | 4.000 |
| Αθλητικός Σύλλογος Ταεκβοντό Νάξου | 1000 | 500 |
| ΠΑΣ Νάξου | - | 1000 |
| ΛΕ ΜΑΝ | - | 500 |
