Συγκεκριμένα, σε ερώτηση του S.C. στον κ. Φουστέρη σχετικά με την πρόθεση της διοίκησης να συμμετάσχει η ομάδα στο Κύπελλο Ελλάδας, ο ίδιος ήταν σαφής και κατηγορηματικός:  

«Η Θύελλα Καμαρίου θα δηλώσει κανονικά συμμετοχή στο Κύπελλο Ελλάδος καθώς πρόκειται για σημαντική διοργάνωση και σύμφωνα με την προκήρυξη η ομάδα μας θα καλεστεί να αγωνιστεί εκτός Σαντορίνης σε γήπεδο με φυσικό χόρτο εάν και εφόσον προκριθεί στην 3η φάση όπου θα συναντηθεί με ομάδα της super league 2. Το Κύπελλο είναι ένας θεσμός εντελώς διαφορετικός από το πρωτάθλημα της Γ΄Εθνικής που επιλέξαμε να μη συμμετάσχουμε στα μπαράζ γιατί όταν έχεις υψηλούς στόχους και δεν εχεις τις ανάλογες υποδομές  δεν μπορείς να τους πετύχεις, ενώ στο κύπελλο οι αγώνες που θα χρειαστεί να παίξεις σε φυσικό χλοοτάπητα -εύχομαι να γίνει- θα είναι λίγοι.»

Από εκεί και πέρα συμπληρώθηκε ο χάρτης των Κυπελλούχων των 52 ενώσεων, οι οποίες θα αγωνιστούν μεταξύ τους στις δύο πρώτες φάσεις. Μεταξύ αυτών και ομάδες της Γ΄ Εθνικής, καθώς ως γνωστό έχουν δικαίωμα συμμετοχής στον θεσμό του Κυπέλλου που διοργανώνουν οι ΕΠΣ.

Πιθανότατα η Θύελλα Καμαρίου θα τοποθετηθεί στην 4η ζώνη βάσει γεωγραφικών κριτηρίων, όπου μία ομάδα προκρίνεται άνευ αγώνα και οι υπόλοιπες 10 αγωνίζονται σε μονούς αγώνες, με τον γηπεδούχο να προκύπτει μέσα από την κλήρωση (όποιος κληρωθεί πρώτος).

Συνήθως η κλήρωση γίνεται στο πρώτο δεκαήμερο του Αυγούστου και ο πρώτος αγώνας διεξάγεται στο τέλος του ίδιου μήνα.

Με βάση τα όσα ίσχυσαν πέρυσι (χωρίς αυτό τα σημαίνει ότι δεν μπορεί να αλλάξει) οι πιθανοί αντίπαλοι της Θύελλας Καμαρίου θα είναι οι εξής:

Αθηνών : ΑΟ Νέας Ιωνίας

Ανατολικής Αττικής : Α.Ο Σαρωνικός Αναβύσσου

Δυτικής Αττικής : Μανδραϊκός Αθλητικός Όμιλος

Δωδεκανήσου : ΑΕΡ Αφάντου

Κορινθίας : ΠΑΣ Κόρινθος 1963 

Χανίων : Αθλητική Ένωση Κυδωνίας

Ευβοίας : AONA FC

Ρεθύμνου : ΠΑΕ Επισκοπή Ρεθύμνου

Λέσβου : Αιγέας Πλωμαρίου

Πειραιά : Εθνικός Πειραιώς 

Οι 53 ομάδες που θα έχουν δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ελλάδος:

Αθηνών : ΑΟ Νέας Ιωνίας

Αιτωλοακαρνανίας : Παναγρινιακός
Ανατολικής Αττικής : Α.Ο Σαρωνικός Αναβύσσου
Αργολίδας : Παναργειακός
Αρκαδίας : Παναρκαδικός
Άρτας : Γ.Α.Σ. Αναγέννηση Άρτας
Αχαΐας : Θυελλα Πατρων
Βοιωτίας : Α.Ο.ΥΠΑΤΟΥ
Γρεβενών : Πυρσός Γρεβενών
Δράμας : Δόξα Βώλακα 
Δυτικής Αττικής : Μανδραϊκός Αθλητικός Όμιλος
Δωδεκανήσου : ΑΕΡ Αφάντου
Έβρου : Μ.Γ.Σ. Ορεστης Ορεστιαδας
Ευβοίας : ΑΟΝΑ
Ευρυτανίας : ΑΟ Ποταμιά
Ζακύνθου : Α.Π.Σ Ζάκυνθος 1961 
Ηλείας : Π.ΑΟ. Βαρδας
Ημαθίας : ΦΑΣ Νάουσα
Ηπείρου : ΠΑΣ Θύελλα Κατσικάς
Ηρακλείου : Αλμυρός Γαζίου
Θεσπρωτίας : Σπάρτακος Γραικοχωρίου
Θεσσαλίας : Ολυμπιακός Βόλου
Θράκης : Πανθρακικός
Καβάλας : Καβάλα
Καρδίτσας : Α.Σ. Ατρόμητος Παλαμά
Καστοριάς : Α.Σ. Αστραπή Μεσοποταμίας
Κέρκυρας : Αθλητική Ένωση Λευκίμμης
Κεφαλληνίας-Ιθάκης : Παλληξουριακός Α.Ο. 
Κιλκίς : Α.Ο. ΚΙΛΚΙΣΙΑΚΟΣ
Κοζάνης : Φ.Σ. Εορδαϊκός Πτολεμαΐδας 
Κορινθίας : ΠΑΣ Κόρινθος 1963 
Κυκλάδων : Θύελλα Καμαρίου
Λακωνίας : ΠΑΣ Σπάρτης
Λάρισας : Α. Ε. Κιλελέρ
Λασιθίου : Άγιος Νικόλαος (A.O.A.N)
Λέσβου : Αιγέας Πλωμαρίου
Μακεδονίας : Α.Ε Ευόσμου 
Μεσσηνίας : Εράνη Φιλιατρών
Ξάνθης : Άρης Αβάτου
Πειραιά : Εθνικός Πειραιώς 
Πέλλας : Απολλων 1960 Κρυας Βρυσης
Πιερίας : Εθνικός Νέου Κεραμιδίου
Πρέβεζας-Λευκάδας : Ερμής Καναλιού
Ρεθύμνου : ΠΑΕ Επισκοπή Ρεθύμνου
Σάμου : Διαγόρας Ικαρίας
Σερρών : ΑΠΟΛΛΩΝ ΠΑΡΑΛΙΜΝΙΟΥ
Τρικάλων : Αθλητικός Όμιλος Τρίκαλα
Φθιώτιδας : Αστέρας Σταυρού
Φλώρινας : Γ.Σ Ερμής Αμυνταίου
Φωκίδας : Απόλλων Ευπαλίου
Χαλκιδικής : ΑΟ Σαρτης 1982
Χανίων : Αθλητική Ένωση Κυδωνίας
Χίου : Θυελλα Χαλκειου