Η ομάδα της Σαντορίνης θα συμμετάσχει στο πρωτάθλημα με ομάδα Β', η οποία όπως και της ΑΕ Μυκόνου θα αγωνιστεί εκτός συναγωνισμού.

Μάλιστα, οι προπονήσεις ήδη έχουν ξεκινήσει, με προπονητή τον Στάθη Φίλων. 

Μετά και τη Συμμετοχή της Σαντορίνης 2020, η Θήρα θα εκπροσωπείται στα ανδρικά πρωταθλήματα με 4 ομάδες (ΑΟ Πύργου, Καρτεράδος, Πανθηραϊκός και Σαντορίνη), κάτι που έχει αν συμβεί αρκετά χρόνια. 

Μεγάλη θα είναι όμως και η συμμετοχή του συλλόγου στα αναπτυξιακά πρωταθλήματα, καθώς έχει δηλώσει συμμετοχή σε: Κ18, Κ16, Κ14 και Κ12.