Στα ημιτελικά του Κυπέλλου έχουν προκριθεί οι Θύελλα Καμαρίου και Α.Ο Πάρου, ο νικητής του ζευγαριού Παμμηλιακός-Πανσιφναϊκός και ένας εκ των Ανδριακό, Ελλάς, Α.Ε Μυκόνου.
Ο νοκ άουτ αγώνας Ανδριακός-Ελλάς Σύρου για το Κύπελλο έχει προγραμματιστεί για την Πέμπτη 22 Φεβρουαρίου 2024 στο Δημοτικό Στάδιο της Άνδρου.
Η ανακοίνωση της ΕΠΣ Κυκλάδων για την κλήρωση αναφέρει:
«Σας ενημερώνουμε ότι η κλήρωση της Β Φάσης για την ανάδειξη του Πρωταθλητή της Α Κατηγορίας «BLUE STAR FERRIES», καθώς επίσης και της Ημιτελικής Φάσης του Κυπέλλου Κυκλάδων «BIOCLEAN» θα γίνουν την Παρασκευή 16/02/2024 στις 11.00 το πρωί, στα γραφεία της Ε.Π.Σ. Κυκλάδων»
